Der NLWKN bewirtschaftet eine Vielzahl an landeseigenen Sperrwerken. Diese Sperrwerke und Siele dienen dem Sturmflut- und Hochwasserschutz sowie der Entwässerung; wobei auch Belange der Schifffahrt berücksichtigt werden müssen. Das bekannteste Sperrwerk ist das Emssperrwerk.